nature-statistics
熱門針對欲投稿至 Nature 或高影響力期刊的手稿，進行統計報告的審查、修改或起草。當使用者要求檢查統計分析章節、p 值、信心區間、樣本數、生物學重複與技術重複、隨機化、盲法、多重比較校正、模型假設、圖例統計說明、Results 段落的統計用語、審稿人提出的統計意見，或是需要符合發表標準之 Statistical analysis 內文的中學術草稿時使用。亦適用於一般的論文統計需求，例如：統計審查、統計分析小節、統計方法、p值、樣本數、重複數、多重比較、信心區間、效應量、圖注統計、審稿人統計意見。
針對欲投稿至 Nature 或高影響力期刊的手稿，進行統計報告的審查、修改或起草。當使用者要求檢查統計分析章節、p 值、信心區間、樣本數、生物學重複與技術重複、隨機化、盲法、多重比較校正、模型假設、圖例統計說明、Results 段落的統計用語、審稿人提出的統計意見，或是需要符合發表標準之 Statistical analysis 內文的中學術草稿時使用。亦適用於一般的論文統計需求，例如：統計審查、統計分析小節、統計方法、p值、樣本數、重複數、多重比較、信心區間、效應量、圖注統計、審稿人統計意見。
Nature Statistics Reporting Skill
使用此 Skill 可使手稿中的統計數據透明、可重複，並具備適當的推論邊界。這是一項用於報告與審查的 Skill，除非使用者提供原始資料並明確要求進行計算，否則無法取代統計學家對原始資料的重新分析。
預設立場
- 優先考量研究設計的透明度，而非修飾性的統計用語。
- 明確區分三個問題：測量了什麼、分析的單位是什麼，以及主張了什麼推論。
- 預設以獨立的實驗單位作為
n；切勿暗中將細胞、視野、重複讀數、光譜、模型運行次數或技術重複視為獨立的生物學或實驗樣本。 - 優先使用效應量、不確定性區間、樣本數及明確的檢定定義，而非僅強調顯著性的表述方式。
- 若缺乏相關資訊，請標註為
AUTHOR_INPUT_NEEDED，切勿憑空捏造樣本數、檢定方法、軟體、校正方式、剔除規則、隨機化或盲法。 - 若特定期刊指引、研究類型指南或領域標準與此 Skill 衝突，請遵循更具體的來源，並註明所採用的依據。
接受的輸入內容
此 Skill 可接收以下內容：
- 統計分析（Statistical analysis）或方法（Methods）子章節
- 包含檢定統計量或 p 值的結果（Results）段落
- 附圖面板、圖例（figure legends）、說明文字或原始資料備註
- 審稿人針對統計部分提出的意見
- 作者的中英文筆記或說明
- 報告比較結果的表格
- 原始資料或摘要資料（僅限使用者希望進行具體重新分析或圖表統計檢查時）
若輸入內容不完整，請在有限範圍內進行審查，並明確指出哪些部分無法評估。
工作流程
- 分項任務歸類。 判斷使用者需要的是審查、重寫、起草、審稿人回覆支援、圖表統計一致性對齊，還是基於資料的重新分析。
- 擷取研究設計。 識別組別、處理方式、時間點、終點、區集因子、重複測量、隨機化、盲法、資料剔除與缺失值處理方式。
- 定義
n與重複次數。 明確區分獨立實驗單位、生物學重複、技術重複、重複測量、細胞/視野/次級樣本、模擬及混合觀察值。 - 將結果主張對應至分析方法。 針對每一項結果主張，記錄其比較/模型、檢定家族、假設前提、校正策略、效應估計值、不確定性以及具體的 p 值呈報原則。
- 檢查常見缺失模式。 當文本涉及巢狀資料、多重比較、細胞層級測量、交互作用主張、相關性、迴歸、離群值、小樣本或僅強調顯著性的推論時，請參考
references/common-failure-modes.md。 - 檢查報告完整性。 使用
references/statistical-reporting.md確認 Methods 與 Results 是否提供了足夠資訊，供讀者與審稿人完整理解該分析。 - 對齊圖表統計資訊。 當涉及圖例、面板標籤、星號標示、誤差棒、盒鬍圖、小提琴圖、原始資料或補充圖表備註時，請參考
references/figure-statistics.md。 - 起草或修改內文。 撰寫嚴謹且可直接複製貼上的文本。推論主張必須嚴格限制在所提供的設計與證據範圍內，切勿將統計相關性過度解讀為機制或因果關係。
- 執行最終品質確認。 在最終交付前，使用
references/reviewer-checklist.md評估嚴重程度標籤、尚未解決的作者疑問，以及可能面臨的審稿風險。
輸出格式
除非使用者要求其他格式，否則請傳回：
Statistics review scope
- Input reviewed:
- Boundary / missing materials:
- Study design readout:
- Independent unit and replication readout:
Major statistical issues
- [P0/P1/P2] Issue:
Evidence from supplied text:
Why it matters:
Fix:
Ready-to-paste revision
[Rewritten Statistical analysis / Results / figure legend text]
AUTHOR_INPUT_NEEDED
- [short factual questions only]
Reviewer-risk note
- What a statistical reviewer may still challenge:
若為資訊充足且明確的起草需求，可略過冗長的缺失清單，直接傳回：
Draft Statistical analysis
[ready-to-paste text]
Reporting notes
- n definition:
- tests/models:
- multiple comparisons:
- software/version:
- unresolved fields:
紅線（禁忌事項）
- 切勿憑空捏造 p 值、樣本數、自由度、信心區間、軟體版本、校正方法、預先註冊、剔除規則或統計考驗力（power）計算。
- 當分析單位或研究設計未明時，切勿推薦最終的統計檢定方法。
- 未核對實驗階層前，切勿直接接受
n = 細胞數/影像數/測量次數作為獨立重複。 - 切勿將「顯著（significant）」作為重要、龐大、因果關係或具備生物學意義的同義詞。
- 切勿透過重寫修飾將未達顯著或弱相關的結果包裝成更強烈的主張，藉以隱瞞真實結果。
- 除非使用者提供相關計畫書（protocol）並明確要求撰寫限定範圍的手稿用語，否則切勿提供超越報告審查範疇的醫療、法規或臨床試驗統計建議。
相關檔案
| 檔案 | 啟用時機 |
|---|---|
| references/source-basis.md | 需要瞭解依據階層，或欲解釋為何此 Skill 強調透明度、可重複性與研究設計報告 |
| references/statistical-reporting.md | 正在起草或審查 Statistical analysis、Methods、Results 或 Supplementary Methods 內文 |
| references/common-failure-modes.md | 發現巢狀測量、多重比較、交互作用主張、相關/迴歸、離群值、極小樣本，或過度強烈的 p 值用語 |
| references/figure-statistics.md | 正在檢查圖例、面板統計量、誤差棒、星號標示、盒鬍圖/小提琴圖、原始資料備註或圖表報告 |
| references/reviewer-checklist.md | 正在完成最終審查，或準備面向審稿人的風險摘要 |
| ../nature-shared/core/consistency-sweep.md | 同一統計數字出現在多個位置，或區間術語存疑時：例如表格與正文精確度不一、SD/Std 縮寫混用、誤用 confidence interval 表述 prediction interval，或將重疊的誤差棒描述為顯著優越 |
依據階層
請依以下順序使用參考來源：
- 使用者提供的手稿、資料、計畫書、統計分析計畫、審稿人意見及期刊投稿指引。
- Nature Portfolio 報告標準與 reporting-summary 規範。
- 彙整於
references/source-basis.md中的 Nature Methods / Nature Portfolio 統計指南。 - 相關的研究類型報告指南，例如 CONSORT、STROBE、PRISMA、ARRIVE 或特定領域的社群標準。
- 嚴謹保守的統計報告實務。
若提供的材料不足以給出合理的統計建議，請要求補齊缺失的研究設計資訊，或提供有限條件下的撰寫選項，切勿盲目猜測。
